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祝贺6163银河网站客户发表的第二篇Nature Genetics 文章
发布日期:2012-12-18浏览:

研究组介绍

由复旦大学遗传学研究所、遗传工程国家重点实验室余龙教授领衔,联系了国内外30个课题组,66位学者开展协作攻关,收集国内7个地区、总计11799例乙型肝炎患者的血细胞DNA样本。包括5480例有乙肝病变的肝癌病例和6319例有乙肝病史但无肝癌的对照者。运用全基因组关联分析技术比对分析,发现了与乙肝癌变风险显著关联的易感基因位点,这在国际学术界属首次报道。研究成果于2012年12月16日在线发表在《Nature Genetics》上。

相关介绍

肝癌是全球致死率高居第三的恶性肿瘤。据报道,全球每年约有70万人死于肝癌。我国卫生部公布的数据称,我国目前总计有9300万乙肝病人,占全世界乙肝患者总数的三分之一以上,且我国每年有35万至40万的肝癌新发病例,占全世界肝癌病人总数的一半以上,我国的肝癌病人中80%以上都有乙肝病史。但是为什么有些乙肝病人发生癌变,而另一些病人不发生癌变,一直困扰着学术界。

本研究介绍

为鉴定出中国人群中对乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)遗传易感性的基因位点,本研究对2514例慢性乙肝病毒携带者(1161例肝癌患者和1353例对照)进行了全基因组关联分析(GWAS),比对分析了这两组人群的全基因组序列中近73万个单核苷酸多态位点的等位基因频率,同时在6个独立的慢性群体(4319例肝癌患者和4966例对照)进行2级验证。联合分析表明,此肝癌致病与否和两个独立的位点显著相关:STAT4上的rs7574865,Pmeta=2.48×10-10,比值比(OR)=1.21;HLA-DQ上的 rs9275319在,Pmeta= 2.72×10 -17,OR =1.49。在155个乙肝病毒携带者的肝癌组织和非癌组织中rs7574865的风险等位点G均与STAT4 mRNA低表达显著相关(Ptrend=0.0008,Ptrend =0.0002)。研究还发现与癌旁非肿瘤组织相比肝癌组织中STAT4 mRNA的表达显著低(P =2.33×10-14),最终在STAT4基因和HLA-DQ基因簇上发现了与乙肝癌变风险显着关联的易感基因位点。

研究意义

利用这一研究成果,可以开发肝癌的基因预警试剂,筛查肝癌的易感人群,从而提前对易感人群进行相应的综合干预和预防措施,降低肝癌发病风险。这对控制乙肝癌变、降低肝癌发病风险和最终战胜肝癌的医学、遗传学研究指出了新的“战略方向”。


原文连接: http://www.nature.com/ng/journal/v45/n1/full/ng.2483.html

Nat Genet. 2012 Dec 16. doi: 10.1038/ng.2483. [Epub ahead of print]
Genetic variants in STAT4 and HLA-DQ genes confer risk of hepatitis B virus-related hepatocellular carcinoma.

本研究的芯片实验由6163银河技术(上海)有限公司完成

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